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推荐实验方案

经优化的实验操作标准流程,涵盖了蛋白标记、点击化学、qPCR、细胞成像和基础实验等常用技术。

NHS 酯活化染料蛋白标记

蛋白标记

使用 NHS 酯活化荧光染料对蛋白质(抗体、BSA 等)赖氨酸残基进行共价标记的标准流程。

操作步骤

  1. 1将目标蛋白溶解于 0.1 M NaHCO₃ 缓冲液(pH 8.3–8.5),浓度 1–10 mg/mL
  2. 2称取适量 NHS 酯染料,溶于无水 DMSO 或 DMF 中(终浓度约 10 mM)
  3. 3按染料:蛋白摩尔比 10:1 – 20:1,在搅拌下逐滴加入染料溶液
  4. 4室温避光反应 1–2 小时(或 4°C 过夜)
  5. 5使用 Sephadex G-25 或 PD-10 脱盐柱去除未反应染料
  6. 6测定标记率(DOL)——A₂₈₀ 和染料 λmax 吸光度计算
  7. 7标记产物 4°C 避光保存,建议添加 0.02% NaN₃

💡 注意事项:缓冲液不得含伯胺(Tris、甘氨酸等),否则与标记反应竞争。推荐使用碳酸盐或磷酸盐缓冲液。

马来酰亚胺巯基标记

蛋白标记

利用马来酰亚胺基团与蛋白游离巯基(半胱氨酸残基)的选择性反应进行位点特异性标记。

操作步骤

  1. 1蛋白溶于 0.1 M 磷酸钠缓冲液(pH 7.0–7.5),含 5 mM EDTA
  2. 2若蛋白不含游离巯基,可用 TCEP 或 DTT 还原二硫键(2–10 mM,室温 30 min)
  3. 3还原后立即脱盐去除过量还原剂
  4. 4按染料:蛋白摩尔比 5:1 – 15:1 加入马来酰亚胺染料(DMSO 溶解)
  5. 5室温避光反应 2 小时(或 4°C 过夜)
  6. 6加入 N-乙基马来酰亚胺(NEM,终浓度 1 mM)淬灭未反应染料
  7. 7脱盐纯化,测定标记率

💡 注意事项:全程保持 pH 7.0–7.5——pH > 8 时马来酰亚胺会与胺基非特异性反应。

铜催化点击化学标记 (CuAAC)

点击化学

利用叠氮化物-炔基环加成(CuAAC)反应,对含炔基或叠氮基修饰的生物分子进行荧光标记。

操作步骤

  1. 1将炔基/叠氮修饰的生物分子溶于 PBS 或 Tris 缓冲液
  2. 2加入 CuSO₄ 溶液(终浓度 0.1–0.5 mM)和 THPTA 配体(Cu:THPTA = 1:5–1:10)
  3. 3加入新鲜配制的抗坏血酸钠(终浓度 1–5 mM)作为还原剂
  4. 4加入叠氮/炔基修饰荧光染料(终浓度 0.1–1 mM)
  5. 5室温或 37°C 反应 30 min – 2 小时
  6. 6脱盐或透析去除铜催化剂和未反应染料

💡 注意事项:铜催化剂浓度需根据底物量优化。细胞内标记推荐使用无铜点击化学(SPAAC)。

SYBR Green I qPCR 反应体系

qPCR

使用启和 ProMaster® qPCR 预混液(含 SYBR Green I)进行实时荧光定量 PCR 的标准方案。

操作步骤

  1. 1冰上配制反应混合液(20 μL 体系):2× ProMaster Mix 10 μL + 上下游引物各 0.4 μL(终浓度 0.2 μM)+ 模板 DNA < 100 ng + 补 ddH₂O 至 20 μL
  2. 2轻柔混匀,短暂离心消除气泡
  3. 3上机运行:95°C 3 min → [95°C 10 s → 60°C 30 s(采集荧光)] × 40 循环
  4. 4熔解曲线分析:95°C 15 s → 60°C 1 min → 以 0.5°C/s 升温至 95°C(连续采集荧光)
  5. 5使用 ΔΔCt 法或标准曲线法进行定量分析

💡 注意事项:推荐做 3 个技术重复。引物效率在 90%–110% 范围内为合格。

荧光原位杂交 (FISH)

细胞成像

使用荧光标记寡核苷酸探针对固定细胞/组织中的特定核酸序列进行原位检测。

操作步骤

  1. 1细胞或组织切片固定(4% PFA,室温 15–20 min),PBS 洗涤 3 次
  2. 2透化处理:0.5% Triton X-100 in PBS,室温 10 min
  3. 3预杂交:加入预杂交液,37–42°C 孵育 30–60 min
  4. 4杂交:加入荧光标记探针(5–50 ng/μL 于杂交液中),37–42°C 避光 2–16 h
  5. 5洗涤:依次用 2× SSC + 0.1% Tween-20(37°C)洗 2–3 次,每次 5–15 min
  6. 6DAPI 复染细胞核(1 μg/mL,室温 5 min),PBS 洗
  7. 7抗荧光淬灭封片剂封片,荧光显微镜观察

💡 注意事项:探针长度、GC 含量和杂交温度需根据靶序列优化。避光操作防止荧光淬灭。

BCA 法蛋白定量

基础实验

使用 BCA (Bicinchoninic Acid) 法测定蛋白浓度,适用于大多数蛋白/多肽样品。

操作步骤

  1. 1配制 BSA 标准品梯度:0、25、50、100、200、500、1000、2000 μg/mL
  2. 2将标准品和待测样品各 25 μL 加入 96 孔板(每个做复孔)
  3. 3按 A 液 : B 液 = 50 : 1 配制 BCA 工作液
  4. 4每孔加入 200 μL BCA 工作液,37°C 孵育 30 min
  5. 5冷却至室温,酶标仪读取 A₅₆₂ 吸光度
  6. 6以标准品浓度为横坐标、吸光度为纵坐标绘制标准曲线
  7. 7根据标准曲线计算样品蛋白浓度

💡 注意事项:BCA 法对还原剂(DTT、β-ME)和螯合剂(EDTA)敏感,需控制浓度。

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