DBCO
目标分子上可接近的叠氮基团
DBCO 是应变炔,可与叠氮发生环加成。普通未修饰蛋白不具备这种配对位点;游离叠氮修饰试剂可能竞争消耗 DBCO。
SF435:DBCO、NH2。按样品反应位点与检测通道选型。
2 款产品
2 个匹配产品
| 产品 / 货号 | 反应形式 | 激发峰 / nm | 发射峰 / nm | 包装规格 | 产品详情 |
|---|---|---|---|---|---|
| SF435-NH2QH-12-1003(NH2) | NH2 | 430 | 545 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| SF435-DBCOQH-12-1003(DBCO) | DBCO | 430 | 545 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg |
需要确认反应形式或检测通道?
QH-12-1003(NH2)
| 产品 / 货号 | 产品形式 | Ex / Em · nm |
|---|---|---|
| SF435-DBCOQH-12-1003(DBCO) | DBCO | 430 / 545 |
| SF435-NH2QH-12-1003(NH2) | NH2 | 430 / 545 |
SF435 提供染料端为游离氨基的 NH2 形式,以及与样品叠氮配对的 DBCO 形式。两者按已有位点、可接受的反应步骤和纯化条件选择。
目标分子上可接近的叠氮基团
DBCO 是应变炔,可与叠氮发生环加成。普通未修饰蛋白不具备这种配对位点;游离叠氮修饰试剂可能竞争消耗 DBCO。
活化羧基;或经 SMCC 等桥接的游离巯基
NH2 是染料提供的伯胺,不是 NHS 活性酯。两个未活化的伯胺不会直接连接。选择羧基活化路线,或先将染料氨基与 SMCC 的 NHS 端反应,再用其 Maleimide 端连接目标巯基。
用同批样品比较纯化后的产物,记录投料、回收、阴性背景及功能。比较不同染料时,匹配目标量和检测设置,再分别评价强度、光漂白或其他终点。
选型要点
根据具体产品的激发、发射参数与仪器光源、滤片或探测器比较;产品名中的数字不替代技术参数。
NH2 染料需要活化羧基或桥接路线;DBCO 需要目标带有可用叠氮。先确认目标修饰状态,再比较所需步骤和清除游离组分的方法。
在相同样品量和采集条件下比较特异信号、阴性背景和功能,以纯化后的偶联物确定工作用量。
样品与实验准备
采用 SMCC 路线时,先连接染料氨基,清除游离交联剂后再与目标巯基反应。按中间体大小选择分离方法,不能默认使用蛋白脱盐柱保留小分子染料。
确认目标叠氮引入并清除游离叠氮试剂,检查缓冲液中的叠氮化钠及其他竞争小分子。以无叠氮目标对照排查吸附背景。
保留同批未标记样品;纯化后再进行浓度、标记度及功能检测。多色检测使用实际偶联物设置单染参考。
目标叠氮用于偶联;游离叠氮修饰试剂和叠氮化钠可能竞争消耗 DBCO。
用产物分析区分转化不足与检测偏差,用无叠氮对照排查吸附背景。
末端炔与 Azide 采用 CuAAC;DBCO 与叠氮采用无铜 SPAAC。
连接染料氨基、分离中间体,再与目标巯基反应;重点检查游离 SMCC、竞争还原剂和小分子分离。
半胱氨酸可能处于二硫键或受保护状态;先确认游离巯基,再决定是否还原。
纯化后同时比较标记度、样品回收、特异信号和背景,避免用总荧光判断效果。
Thermo Fisher Scientific · SMCC and Sulfo-SMCC · MAN0011295 Rev. C.0
区分 NHS 端与 Maleimide 端的反应对象、反应顺序和游离交联剂清除,支持设计 NH2 染料的桥接路线。
Debets MF, van Berkel SS, Schoffelen S, et al. · Chemical Communications · 46(1):97–99 · 2010
研究应变炔与叠氮的无铜反应及酶 PEG 化,介绍应变炔在生物偶联中的应用。
DOI: 10.1039/b917797c
Agard NJ, Prescher JA, Bertozzi CR. · Journal of the American Chemical Society · 126(46):15046–15047 · 2004
介绍利用环张力实现无铜叠氮–炔基偶联的策略,是 SPAAC 生物偶联的基础研究。
DOI: 10.1021/ja044996f
thermofisher.com
反应基团、缓冲液相容性与操作方法。
thermofisher.com
反应基团、缓冲液相容性与操作方法。
Shafer DE, Inman JK, Lees A. · Analytical Biochemistry · 282(1):161–164 · 2000
研究 TCEP 与反应性基团的相互作用,可用于评估还原剂残留及换液方案。
按货号申请说明书、SDS 或批次 CoA;申请 CoA 时请提供瓶签批号。
产品用途、配制、使用条件与储存要求。
对应批次的检验项目与结果。
安全操作、储存及应急处置信息。
先确认样品已有反应位点或需要的识别方式,再选择相应反应性染料或已有偶联物。具体货号分别使用其配制、反应与保存要求。
NH2 是染料本身的游离氨基。与抗体赖氨酸等普通伯胺之间需设计活化或桥接步骤,不能省去连接路线直接混合。
保持目标浓度、采集设置及样品处理一致,结合标记度比较特异信号、阴性背景、回收率和样品功能。单看游离染料或一次终点强度不能评价全部性能。
需使用具体货号的分子量、适用消光系数及蛋白吸收校正参数,并先清除游离染料。未公开的参数可在产品资料标签按货号申请。
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