DBCO
目标分子上可接近的叠氮基团
DBCO 是应变炔,可与叠氮发生环加成。普通未修饰蛋白不具备这种配对位点;游离叠氮修饰试剂可能竞争消耗 DBCO。
Cy5 提供 Streptavidin、CTB、WGA、DBCO、Maleimide、Azide、NHS Ester 产品,按标记或染色用途选型。
7 款产品
7 个匹配产品
| 产品 / 货号 | 反应形式 | 激发峰 / nm | 发射峰 / nm | 包装规格 | 产品详情 |
|---|---|---|---|---|---|
| Cy5 NHS EsterQH-30-3003 | NHS Ester | 640 | 664 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| Cy5 MaleimideQH-30-3003(Maleimide) | Maleimide | 640 | 664 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| Cy5 AzideQH-30-3003(Azide) | Azide | 640 | 664 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| Cy5-StreptavidinQH-15-1015 | Streptavidin | 640 | 664 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| Cy5 WGAQH-30-3003(WGA) | WGA | 640 | 664 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| Cy5 CTBQH-30-3003(CTB) | CTB | 640 | 664 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| Cy5 DBCOQH-30-3003(DBCO) | DBCO | 649 | 667 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg |
需要确认反应形式或检测通道?
QH-30-3003
| 产品 / 货号 | 产品形式 | Ex / Em · nm |
|---|---|---|
| Cy5-StreptavidinQH-15-1015 | Streptavidin | 640 / 664 |
| Cy5 CTBQH-30-3003(CTB) | CTB | 640 / 664 |
| Cy5 WGAQH-30-3003(WGA) | WGA | 640 / 664 |
| Cy5 DBCOQH-30-3003(DBCO) | DBCO | 649 / 667 |
| Cy5 MaleimideQH-30-3003(Maleimide) | Maleimide | 640 / 664 |
| Cy5 AzideQH-30-3003(Azide) | Azide | 640 / 664 |
| Cy5 NHS EsterQH-30-3003 | NHS Ester | 640 / 664 |
Cy5 为标记产物提供荧光读数,反应端决定与样品连接的位点。预偶联探针的识别对象由所连接的蛋白决定,按其染色用途处理。
目标分子上可接近的叠氮基团
DBCO 是应变炔,可与叠氮发生环加成。普通未修饰蛋白不具备这种配对位点;游离叠氮修饰试剂可能竞争消耗 DBCO。
可接近的游离巯基
Maleimide 与游离巯基加成形成含硫醚连接的产物。二硫键中的硫不是可用游离巯基;还原前处理需兼顾样品结构和功能。
末端炔或 DBCO、BCN 等适用应变炔
叠氮染料不直接标记普通伯胺或巯基。先确认目标上的炔基类型,再选择铜催化或应变促进的环加成体系。
蛋白 N 端、赖氨酸及人工引入的伯胺
NHS 酯与伯胺形成酰胺键,水解会消耗活性酯。蛋白上的可用位点通常不止一个,投料比不等于最终标记度。
样品上可接近的生物素
链霉亲和素与生物素非共价结合。游离生物素可占据结合位点,内源性生物素可能产生背景;多价结合还可能造成目标交联。
可接近的 GM1 神经节苷脂
CTB 为霍乱毒素 B 亚基,能够多价结合 GM1。探针本身可能改变 GM1 聚集和膜行为,因此单独的 CTB 信号不能确认脂筏数量或膜微区结构。
可接近的 N-乙酰葡糖胺及唾液酸相关糖链
WGA 为小麦胚芽凝集素。其荧光信号取决于糖链分布和可接近性;固定、通透、温度和孵育时间会改变所见分布,信号不等同于细胞膜总量。
Cy 染料连接蛋白后,局部环境与标记密度可能改变荧光读数。以纯化后目标的等浓度梯度比较信号和背景,同时检查结合或酶活功能。
选型要点
根据具体产品的激发、发射参数与仪器光源、滤片或探测器比较;产品名中的数字不替代技术参数。
需要自行标记时进入反应性染料产品;直接染色时按实际列出的 WGA、CTB 或 Streptavidin 偶联物及其识别对象选型。
按实际样品滴定产品用量,保持采集和处理条件一致,并设置用途对应的对照。
样品与实验准备
列明目标分子量、浓度、已有反应位点及缓冲添加物,选择能分离目标产物和游离染料的方法。不同反应形式使用各自的产品条件。
蛋白偶联物按水相制剂处理;游离染料按具体货号配制。亲和染色同时记录固定、通透、温度、时间和洗涤条件。
保留同批未标记样品;纯化后再进行浓度、标记度及功能检测。多色检测使用实际偶联物设置单染参考。
游离生物素会占据链霉亲和素结合位点,降低对生物素化目标的检测信号。
用未染、仅链霉亲和素和无生物素化探针对照,区分自发荧光、内源性生物素与吸附。
链霉亲和素多价结合可能交联生物素化目标;活细胞运动与聚集研究需考虑这一影响。
CTB 荧光用于观察 GM1 相关分布;点状信号本身不能证明天然脂筏结构。
CTB 时序图像应区分膜周边与胞内信号,单一终点不能确定运输路径。
按模型、组织和追踪时间核对文献,并确认偶联物、组织背景和检测窗口。
WGA 标记可接近的糖链;膜轮廓分割需检查连续性,不能把强度直接当作膜总量。
活细胞中的 WGA 可被内吞;胞内信号需结合时间与定位判断。
固定和通透会改变糖链可接近性,需分别比较膜轮廓、胞内信号和背景。
目标叠氮用于偶联;游离叠氮修饰试剂和叠氮化钠可能竞争消耗 DBCO。
用产物分析区分转化不足与检测偏差,用无叠氮对照排查吸附背景。
末端炔与 Azide 采用 CuAAC;DBCO 与叠氮采用无铜 SPAAC。
半胱氨酸可能处于二硫键或受保护状态;先确认游离巯基,再决定是否还原。
DTT、β-巯基乙醇会竞争消耗 Maleimide;TCEP 残留也可能干扰反应。
去除游离染料后测标记度,再检查功能及保存后的信号变化。
末端炔采用 CuAAC,应变炔采用 SPAAC;确认目标基团后再检查铜与样品的兼容性。
反应基团、催化组分和铜结合添加物是低转化率的首要排查项。
用无反应位点对照区分共价标记与吸附,纯化时同时处理游离染料和催化组分。
Tris、甘氨酸会消耗 NHS 染料;BSA、明胶需与目标蛋白分离,普通换液不能代替这一步。
先排查 NHS 水解和含胺添加物,再区分标记不足、样品损失与结合活性下降。
用吸收校正计算 DOL,区分投料比与实际标记量,再结合回收率和结合活性评价偶联物。
Gruber HJ, Hahn CD, Kada G, et al. · Bioconjugate Chemistry · 11(5):696–704 · 2000
比较 Cy3、Cy3.5、Cy5、Cy7 与 IgG 或亲和素结合后的荧光变化,说明应同时评价标记度和纯化后偶联物的实际信号。
DOI: 10.1021/bc000015m
Mujumdar RB, Ernst LA, Mujumdar SR, Lewis CJ, Waggoner AS. · Bioconjugate Chemistry · 4(2):105–111 · 1993
研究磺化 Cy 活性酯的结构、光谱及含伯胺生物分子标记,适合了解 Cy 活性酯的标记路线。
DOI: 10.1021/bc00020a001
Howarth M, Chinnapen DJF, Gerrow K, et al. · Nature Methods · 3:267–273 · 2006
通过工程化单价蛋白研究多价结合引起的交联。可用于评估探针价态对膜蛋白运动和聚集的影响。
DOI: 10.1038/nmeth861
Cossarizza A, Chang HD, Radbruch A, et al. · European Journal of Immunology · 51(12):2708–3145 · 2021
提供检测设置、对照及实验记录的方法参考,用于设计标记产物的下游评价。
Thermo Fisher Scientific
生物素亲和检测中的样品准备、游离生物素与背景控制。
Kabbani AM, Raghunathan K, Lencer WI, Kenworthy AK, Kelly CV. · PNAS · 117(26):14978–14986 · 2020
研究 CTB 多价结合对 GM1 排布及膜形态的影响,提示需要评估探针对观察对象的扰动。
Chazotte B. · Cold Spring Harbor Protocols · 2011(5):pdb.prot5623 · 2011
介绍以 WGA 识别糖链的膜染色方法,适合参考样品处理与成像设计。
DOI: 10.1101/pdb.prot5623
Debets MF, van Berkel SS, Schoffelen S, et al. · Chemical Communications · 46(1):97–99 · 2010
研究应变炔与叠氮的无铜反应及酶 PEG 化,介绍应变炔在生物偶联中的应用。
DOI: 10.1039/b917797c
Agard NJ, Prescher JA, Bertozzi CR. · Journal of the American Chemical Society · 126(46):15046–15047 · 2004
介绍利用环张力实现无铜叠氮–炔基偶联的策略,是 SPAAC 生物偶联的基础研究。
DOI: 10.1021/ja044996f
Shafer DE, Inman JK, Lees A. · Analytical Biochemistry · 282(1):161–164 · 2000
研究 TCEP 与反应性基团的相互作用,可用于评估还原剂残留及换液方案。
Baldwin AD, Kiick KL. · Bioconjugate Chemistry · 22(10):1946–1953 · 2011
以模型加成物研究含巯基环境下的交换反应,为偶联物稳定性评价提供参考。
DOI: 10.1021/bc200148v
Presolski SI, Hong VP, Finn MG. · Current Protocols in Chemical Biology · 3(4):153–162 · 2011
介绍 CuAAC 催化体系与反应评价,适合带末端炔基样品的方法设计。
Hong V, Presolski SI, Ma C, Finn MG. · Angewandte Chemie International Edition · 48(52):9879–9883 · 2009
讨论配体、铜催化与生物分子条件对反应的影响,为 CuAAC 转化不足的排查提供依据。
Nanda JS, Lorsch JR. · Methods in Enzymology · 536:87–94 · 2014
以 FAM 活性酯标记蛋白为例,介绍伯胺反应和标记效率评价。适合安排 NHS 标记流程,投料与反应条件需按实际染料和样品确定。
Vira S, Mekhedov E, Humphrey G, Blank PS. · Analytical Biochemistry · 402(2):146–150 · 2010
以 FITC 标记抗 HA 抗体,比较标记度与抗原结合的变化。适合设计投料梯度及纯化后的功能评价,不能单凭 DOL 高低选择偶联物。
按货号申请说明书、SDS 或批次 CoA;申请 CoA 时请提供瓶签批号。
产品用途、配制、使用条件与储存要求。
对应批次的检验项目与结果。
安全操作、储存及应急处置信息。
先确认样品已有反应位点或需要的识别方式,再选择相应反应性染料或已有偶联物。具体货号分别使用其配制、反应与保存要求。
以具体货号为准。连接形式或已有偶联物可能有不同参数;比较时查看产品表和各货号技术参数,不能只按染料名称替代。
保持目标浓度、采集设置及样品处理一致,结合标记度比较特异信号、阴性背景、回收率和样品功能。单看游离染料或一次终点强度不能评价全部性能。
需使用具体货号的分子量、适用消光系数及蛋白吸收校正参数,并先清除游离染料。未公开的参数可在产品资料标签按货号申请。
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