DBCO
目标分子上可接近的叠氮基团
DBCO 是应变炔,可与叠氮发生环加成。普通未修饰蛋白不具备这种配对位点;游离叠氮修饰试剂可能竞争消耗 DBCO。
BODIPY 530/550 提供 WGA、DBCO、Maleimide、Azide、NHS Ester 产品,按标记或染色用途选型。
5 款产品
5 个匹配产品
| 产品 / 货号 | 反应形式 | 激发峰 / nm | 发射峰 / nm | 包装规格 | 产品详情 |
|---|---|---|---|---|---|
| BODIPY530/550 Succinimidyl EsterQH-40-4005 | NHS Ester | 534 | 551 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| BODIPY530/550 MaleimideQH-40-4005(Maleimide) | Maleimide | 534 | 551 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| BODIPY530/550 AzideQH-40-4005(Azide) | Azide | 534 | 551 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| BODIPY 530/550 DBCOQH-40-4005(DBCO) | DBCO | 534 | 551 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg | |
| BODIPY 530/550 WGAQH-40-4005(WGA) | WGA | 534 | 551 | 1 mg / 5 mg / 10 mg / 25 mg / 100 mg |
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QH-40-4005
| 产品 / 货号 | 产品形式 | Ex / Em · nm |
|---|---|---|
| BODIPY 530/550 WGAQH-40-4005(WGA) | WGA | 534 / 551 |
| BODIPY 530/550 DBCOQH-40-4005(DBCO) | DBCO | 534 / 551 |
| BODIPY530/550 MaleimideQH-40-4005(Maleimide) | Maleimide | 534 / 551 |
| BODIPY530/550 AzideQH-40-4005(Azide) | Azide | 534 / 551 |
| BODIPY530/550 Succinimidyl EsterQH-40-4005 | NHS Ester | 534 / 551 |
按 BODIPY 530/550 的完整名称区分染料,再选择适用的反应端或 WGA 偶联物。含 X 的产品名称作为独立形式保留,其结构和参数按具体货号确认。
目标分子上可接近的叠氮基团
DBCO 是应变炔,可与叠氮发生环加成。普通未修饰蛋白不具备这种配对位点;游离叠氮修饰试剂可能竞争消耗 DBCO。
可接近的游离巯基
Maleimide 与游离巯基加成形成含硫醚连接的产物。二硫键中的硫不是可用游离巯基;还原前处理需兼顾样品结构和功能。
末端炔或 DBCO、BCN 等适用应变炔
叠氮染料不直接标记普通伯胺或巯基。先确认目标上的炔基类型,再选择铜催化或应变促进的环加成体系。
蛋白 N 端、赖氨酸及人工引入的伯胺
NHS 酯与伯胺形成酰胺键,水解会消耗活性酯。蛋白上的可用位点通常不止一个,投料比不等于最终标记度。
可接近的 N-乙酰葡糖胺及唾液酸相关糖链
WGA 为小麦胚芽凝集素。其荧光信号取决于糖链分布和可接近性;固定、通透、温度和孵育时间会改变所见分布,信号不等同于细胞膜总量。
BODIPY 染料的结构、溶剂与所连接分子会影响检测表现。储备液加入水相样品后检查浑浊、吸附和聚集,并在最终缓冲液中评价纯化产物。
选型要点
根据具体产品的激发、发射参数与仪器光源、滤片或探测器比较;产品名中的数字不替代技术参数。
蛋白、多肽或修饰核酸的共价标记选对应反应性形式;糖链识别使用 WGA 偶联物。染料名称本身不确定靶向性。
按实际样品滴定产品用量,保持采集和处理条件一致,并设置用途对应的对照。
样品与实验准备
先做小量稀释,保持最终有机溶剂比例一致。出现浑浊、沉淀或明显管壁吸附时,先调整配制与加入方式,再比较投料梯度。
列明目标分子量、浓度、已有反应位点及缓冲添加物,选择能分离目标产物和游离染料的方法。不同反应形式使用各自的产品条件。
保留同批未标记样品;纯化后再进行浓度、标记度及功能检测。多色检测使用实际偶联物设置单染参考。
WGA 标记可接近的糖链;膜轮廓分割需检查连续性,不能把强度直接当作膜总量。
活细胞中的 WGA 可被内吞;胞内信号需结合时间与定位判断。
固定和通透会改变糖链可接近性,需分别比较膜轮廓、胞内信号和背景。
目标叠氮用于偶联;游离叠氮修饰试剂和叠氮化钠可能竞争消耗 DBCO。
用产物分析区分转化不足与检测偏差,用无叠氮对照排查吸附背景。
末端炔与 Azide 采用 CuAAC;DBCO 与叠氮采用无铜 SPAAC。
半胱氨酸可能处于二硫键或受保护状态;先确认游离巯基,再决定是否还原。
DTT、β-巯基乙醇会竞争消耗 Maleimide;TCEP 残留也可能干扰反应。
去除游离染料后测标记度,再检查功能及保存后的信号变化。
末端炔采用 CuAAC,应变炔采用 SPAAC;确认目标基团后再检查铜与样品的兼容性。
反应基团、催化组分和铜结合添加物是低转化率的首要排查项。
用无反应位点对照区分共价标记与吸附,纯化时同时处理游离染料和催化组分。
Tris、甘氨酸会消耗 NHS 染料;BSA、明胶需与目标蛋白分离,普通换液不能代替这一步。
先排查 NHS 水解和含胺添加物,再区分标记不足、样品损失与结合活性下降。
用吸收校正计算 DOL,区分投料比与实际标记量,再结合回收率和结合活性评价偶联物。
Loudet A, Burgess K. · Chemical Reviews · 107(11):4891–4932 · 2007
综述 BODIPY 骨架的合成、衍生化及光谱性质,适合了解不同 BODIPY 结构的选型背景。
DOI: 10.1021/cr078381n
Ksenofontova KV, Kerner AA, Ksenofontov AA, et al. · Molecules · 27(22):7911 · 2022
以 NHS-Ph-BODIPY 为研究对象,比较溶剂及蛋白连接后的光谱变化,提示需在最终样品环境中评价偶联物。
Chazotte B. · Cold Spring Harbor Protocols · 2011(5):pdb.prot5623 · 2011
介绍以 WGA 识别糖链的膜染色方法,适合参考样品处理与成像设计。
DOI: 10.1101/pdb.prot5623
Cossarizza A, Chang HD, Radbruch A, et al. · European Journal of Immunology · 51(12):2708–3145 · 2021
提供检测设置、对照及实验记录的方法参考,用于设计标记产物的下游评价。
Debets MF, van Berkel SS, Schoffelen S, et al. · Chemical Communications · 46(1):97–99 · 2010
研究应变炔与叠氮的无铜反应及酶 PEG 化,介绍应变炔在生物偶联中的应用。
DOI: 10.1039/b917797c
Agard NJ, Prescher JA, Bertozzi CR. · Journal of the American Chemical Society · 126(46):15046–15047 · 2004
介绍利用环张力实现无铜叠氮–炔基偶联的策略,是 SPAAC 生物偶联的基础研究。
DOI: 10.1021/ja044996f
Shafer DE, Inman JK, Lees A. · Analytical Biochemistry · 282(1):161–164 · 2000
研究 TCEP 与反应性基团的相互作用,可用于评估还原剂残留及换液方案。
Baldwin AD, Kiick KL. · Bioconjugate Chemistry · 22(10):1946–1953 · 2011
以模型加成物研究含巯基环境下的交换反应,为偶联物稳定性评价提供参考。
DOI: 10.1021/bc200148v
Presolski SI, Hong VP, Finn MG. · Current Protocols in Chemical Biology · 3(4):153–162 · 2011
介绍 CuAAC 催化体系与反应评价,适合带末端炔基样品的方法设计。
Hong V, Presolski SI, Ma C, Finn MG. · Angewandte Chemie International Edition · 48(52):9879–9883 · 2009
讨论配体、铜催化与生物分子条件对反应的影响,为 CuAAC 转化不足的排查提供依据。
Nanda JS, Lorsch JR. · Methods in Enzymology · 536:87–94 · 2014
以 FAM 活性酯标记蛋白为例,介绍伯胺反应和标记效率评价。适合安排 NHS 标记流程,投料与反应条件需按实际染料和样品确定。
Vira S, Mekhedov E, Humphrey G, Blank PS. · Analytical Biochemistry · 402(2):146–150 · 2010
以 FITC 标记抗 HA 抗体,比较标记度与抗原结合的变化。适合设计投料梯度及纯化后的功能评价,不能单凭 DOL 高低选择偶联物。
按货号申请说明书、SDS 或批次 CoA;申请 CoA 时请提供瓶签批号。
产品用途、配制、使用条件与储存要求。
对应批次的检验项目与结果。
安全操作、储存及应急处置信息。
先确认样品已有反应位点或需要的识别方式,再选择相应反应性染料或已有偶联物。具体货号分别使用其配制、反应与保存要求。
需实测纯化后的标记度和信号。高局部标记密度可能改变荧光读数,应同时评价背景、回收和样品功能。
保持目标浓度、采集设置及样品处理一致,结合标记度比较特异信号、阴性背景、回收率和样品功能。单看游离染料或一次终点强度不能评价全部性能。
需使用具体货号的分子量、适用消光系数及蛋白吸收校正参数,并先清除游离染料。未公开的参数可在产品资料标签按货号申请。
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